Antonio, todo depende con la antelación con la sepas de su ausencia. Una cosa es una ausencia de última hora (como le ocurre a Doña Letizia cuando está embarazada, que tiene bastantes indisposiciones) y otra es una ausencia prevista con tiempo (podemos decir, que premeditada).
De forma habitual, invita quien hace de anfitrión (invitan los anfitriones), con lo que es poco correcto, que invite una persona que no va a estar en un acto. Personalmente, haría la invitación en nombre del Directo General.
Si eres un poco más maquiavélico (pues el protocolo tiene un componente importante de hipocresía, según mi opinión, que nadie se lo tome a mal), puede invitar el Presidente, y disculparle después en el acto diciendo que por una indisposición o un compromiso importante de última hora no pudo acudir.
Como te dije, personalmente, me inclino por la primera opción, que invite el Director General.
Tienes otra fórmula, que es invitar en su nombre: Don Nombre+Apellidos y en su nombre Don Nombre+Apellidos ...tiene el honor (el placer, etc.) ...