Fernado, no se si entiendo bien tu pregunta pero intentaré responderte.
Vamos a empezar por diferenciar, dentro de la organización de un evento, a la empresa organizadora o el anfitrión, que es de quien parte la idea de organizar el congreo (p.e., "X Congreso Anual de Medicina Cardiovascular" organizado por la Univ. Complutense de Madrid" -es un caso totalmente ficticio_ en la que la universidad es el organizador del evento (de cara al escaparate); por otro lado esta la OPC o empresa organizadora de eventos (excatamente opc=organizadora profesional de congresos) que es un intermediario que se ocupa de planificar, desarrollar y optimizar el evento de forma profesional en base a la filosofia y objetivos de la empresa anfitriona (la universidad en este ejemplo). En base a esto...
La agencia o empresa que organiza el evento (OPC) lo forman los que van identificados durante el congreso con la tarjeta de "organización" (no se incluye ninguna expecificación). El cargo de cada persona dentro de dicha asociación depende de la su politica de empresa. El papel de opc siempre es de segundo plano: el mejor organizador es el que lo hace todo, soluciona todo pero nunca se le ve.
La opc se suele dividir en la secretaria administrativa (se ocupa de todo el desarrollo y logistica del evento, lo cual incluye principalmente del aglutinamiento, gestión y optimización de proveedores y la atención de clientes o asistentes al acto) y la secretaria tecnica (que se ocupa de gestionar temas como desarrollo y manteniento de páginas web, gabinete de medios de comunicación - que a veces se crea como un ente individual-,etc). A veces solo existe una única secretaria administrativa que engloba todo. Pero de cara el cliente, solo existe una persona: el ejecutivo de cuentas que es el responsable del evento.
Otra cosa es el comite organizador; este suele estan compuesto de personas de la entidad que decide organizar el evento (volviendo al ejemplo, la universidad) y patrocinadores/colaboradores directamente involucrados en el acto (p.e., el dtor del Hospital 12 de Octubre de Madrid o el presidente de Bayern -una farmaceutica-). La labor del comite organizador es determinar las directrices que sirven de guias e actuación para la opc y que chequeará y dará el ok a todas las acciones que vayan teniendo que desarrollarse. Ellos serán quienes designen a los miembros de una secretaria de investigación o profesional, a veces también llamada como secretaria tecnica (cuando esta no existe en la opc) que se ocupa de gestionar los contenidos de los discursos y sus caracteristicas. Los cargos de cada son los que son segun las entidades a las que pertenezcan.
También suele haber un comité de Honor, formado por personas relevantes dentro del sector (p.e. el dtor del centro donde se organiza el congreso o un profesioal con mucho prestigio y nombre) y del ambito institucional (p.e. el/la delegado/a de sanidad en la CA). Dentro de este hay un Presidente o Presidenta de Honor que preside el acto en la sesión de apertura y clausura, así como cenas o actividades paralelas de gala. La labor del comite honorifico es meramente eso, honorifico: no dictan normas, en todo caso opinan, y su papel es de dar fe y relevancia al evento.
Del protocolo general (desarrollo, banderas, lineas de recepción, organización de salas vip, recepciones, delegacines, hospitality desk, etc) se ocupa la OPC; del protocolo respecto a prelación de cargos se ocupa en un 95% de los casos, la empresa organizadora (la universidad) que suele tener un dpto, generalmente adjunto a presidencia o al comunicación, que dicen que autoridades van, cual es su cargo, relevancia, etc.. a lo sumo, la opc chequea que no haya errores en cuanto a los cargos institucionales (y al final, siempre dependera de quien "paga")
No se si tanto escribir ha ayudado o confundido.
Un saludo,